- Berni Canani, R., De Filippis, F., et al. 2017. Appl. Environ. Microbiol. 83: e01206-17. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.01206-17.
- Bertuzzi, A.S., Walsh, A.M., Sheehan, J.J., et al. (2018) mSystems 3:1–15 . https://dx.doi.org/10.1128/msystems.00211-17.
- Böhme, K., Calo-Mata, P., Barros-Velázquez, P., Ortea, I. 2019. TrAC Trends Anal. Chem. 110: 221–232. https://dx.doi.org/10.1016/j.trac.2018.11.005.
- Bokulich, N. A., Mills, D.A. 2013. Appl. Environmen. Microbiol. 79: 2519–226. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.03870-12.
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Holmes, S. P. 2017. ISME J. 11: 2639–4263. https://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.119.
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A.J.A., Holmes, S. P. 2016. Nature Meth. 13: 581–583. https://dx.doi.org/10.1038/nmeth.3869.
- Cubero-Leon, E., Peñalver, R., Maquet, A. 2014. Frin 60: 95–107. https://dx.doi.org/10.1016/j.foodres.2013.11.041.
- De Filippis, F., Genovese, A., Ferranti, P., et al. 2016. Sci. Rep. 6: 21871. https://dx.doi.org/10.1038/srep21871.
- De Filippis, F., Parente, E., Ercolini, D. 2017a. Microbial Biotechnol. 10: 91–102. https://dx.doi.org/10.1111/1751-7915.12421.
- De Filippis, F., Laiola, M., Blaiotta, G., Ercolini, D. 2017b. Appl. Environ. Microbiol., 83: e00905–17. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.00905-17.
- De Filippis, F., La Storia, A., Stellato, G. et al. 2014. PLoS One 9: e89680. https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0089680.
- De Filippis, F., Parente, E., Danilo Ercolini. 2018a. Ann. Rev. Food Sci. Technol. 9. https://dx.doi.org/10.1146/annurev-food-030117-012312.
- De Filippis, F., Parente, E., Zotta, T., Ercolini, D. 2018b. Int. J. Food Microbiol. 265: 9–17. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2017.10.028.
- Douglas, G. M., Maffei, V. J., Zaneveld, J. et al. 2019. bioRxiv 8 (June). https://dx.doi.org/10.1101/672295.
- Fiehn, O. 2002. Plant Mol. Biol. 48:155–171. https://dx.doi.org/10.1023/A:1013713905833
- Fouhy, F., Clooney, A. G., Stanton, C., Claesson, M.J., Cotter, P. D. 2016. BMC Microbiol. 16: 123. https://dx.doi.org/10.1186/s12866-016-0738-z.
- Garofalo, C., Osimani, A., Milanovic, V., Aquilanti, L., et al. 2015. Food Microbiol. 49: 123-133. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2015.01.017
- Gasperi, F., Gallerani, G., Boschetti, A., et al. 2001. J. Sci. Food Agric. 81: 357–363. https://doi.org/10.1002/1097-0010(200102)81:3<357::AID-JSFA818>3.0.CO;2-O.
- Gobbetti, M., Di Cagno, R., Calasso, M., et al. 2018. Trends Food Sci. Technol. 78: 244–254. https://dx.doi.org/10.1016/j.tifs.2018.06.010.
- Guidone, A., Zotta, T., Matera, A., et al. 2016. Int. J. Food Microbiol. 216: 9–17. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.09.002.
- Kuuliala, L., Al Hage, Y., Ioannidis, A.-G., Sader, M., Kerckhof, F.-M., Vanderroost, M., Boon, N. et al. 2018. Food Microbiol. 70: 232–44. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2017.10.011.
- Le Boucher, C., Courant, F., Jeanson, S., et al. 2013. Food Chem. 141:1032–1040 . https://dx.doi.org/10.1016/j.foodchem.2013.03.094
- Marino, M., Dubsky de Wittenau, G., Saccà, E. et al. 2019. Food Microbiol. 79: 123–131. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2018.12.007.
- Mauriello, G., Moio, L., Genovese, A., Ercolini, D. 2003. J. Dairy Sci. 86: 486–497. https://dx.doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(03)73627-3
- Meola, M., Rifa, E., Shani, N., et al. 2019. BMC Genomics 20:560. https://dx.doi.org/10.1186/s12864-019-5914-8.
- Montel, M.-C., Buchin, S., Mallet, A., et al. 2014. Int. J. Food Microbiol. 177: 136–54. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2014.02.019.
- Nature Editorial 2016. Nature Microbiology 1: 16112. https://dx.doi.org/10.1038/nmicrobiol.2016.112
- Parente, E., Cocolin, L., De Filippis, F., Zotta, T., et al. 2016. Int. J. Food Microbiol. 219 28–37. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.12.001.
- Parente, E De Filippis, F., Ercolini, D. et al. 2019. Int. J. Food Microbiol. 305: 108249. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108249.
- Pisano, M. B., Scano, P., Murgia, A. et al. 2016. Food Chem. 192: 618–624. https://dx.doi.org/10.1016/j.foodchem.2015.07.061.
- Qin J, et al. 2010. Nature. 464: 59-65. https://dx.doi.org/10.1038/nature08821.
- Quince, C., Walker, A.W., Simpson, J.T., Loman, N.J., Segata, N. 2017. Nat. Biotechnol. 35: 833-844. https://dx.doi.org/10.1038/nbt.3935.
- Ricciardi, A., De Filippis, F., Zotta, T. et al. 2016. Int. J. Food Microbiol. 236: 138–417. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2016.07.031.
- Sedlar, K., Kupkova, K., Provaznik, I. 2017. Comput. Struct. Biotecnol. J. 15: 48-55. https://dx.doi.org/10.1016/j.csbj.2016.11.005.
- Stellato, G., De Filippis, F., La Storia, A., Ercolini, D. 2015. Appl. and Envirn. Microbiol. 81:7893-7904. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02294-15.
- Vandeputte, D., Tito, R.Y., Vanleeuwen, R., Falony, G., Raes, J. 2017. FEMS Microbiol. Rev. 41: S154–67. https://dx.doi.org/10.1093/femsre/fux027.
- Walsh, A. M., Crispie, F., O’Sullivan, O. et al., 2018. Microbiome 6: 50. https://dx.doi.org/10.1186/s40168-018-0437-0.
- Yeluri, J., Bhagya. R., McSweeney, P. L. H. et al., 2018. Front. Microbiol. 9: 1890–1912. https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2018.01020.
- Zhou, J., He, Z., Yang, Y., Deng, Y., Tringe, S. G., Alvarez-Cohen. L. 2015. mBio 6 (1). https://dx.doi.org/10.1128/mBio.02288-14.
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Il cibo che vorrei: scadenza dei termini per la presentazione dei progetti
I termini per la presentazione dei progetti sono scaduti. E’ pervenuto un solo progetto (relativo alla sfida “Il formaggio che vorrei”) che sarà comunque valutato.
Statistical computing with R
The lectures for “Statistical computing with R” will begin on March 27th, 2019, in room B6 (Library building, Campus di Macchia Romana, Potenza, Italy) at 15:00. Be there or be square!
Lezioni a tutta birra: “Una lezione di m….”
Quando eravamo piccoli, ma piccoli piccoli, molta della nostra vita e quella dei nostri genitori girava intorno a come stava il nostro pancino. Nè noi (che avevamo allora desideri semplici) né i nostri genitori immaginavamo quanto fosse densamente abitato il pancino né quanto fosse complessa la relazione fra i sui numerosi abitanti e la nostra salute. Beh, magari adesso ce ne curiamo di meno, ma quello che si agita dentro di noi (un mondo di microrganismi, il microbioma) condiziona fortemente la nostra salute e il nostro benessere. Ne parleremo, senza troppi tabù e con la consueta leggerezza nella prossima lezione a tutta birra. Intervenite numerosi e, visto che è San Valentino, portate i vostri fidanzati/e/sposi/e…
Interverranno:
- io vi dirò, in parole semplici, cos’è il microbioma umano, come si studia, perché è importante per la nostra salute e come possiamo “mantenerlo in forma” o intervenire quando perde il suo equilibrio
- il Dott Orazio Ignomirelli, unità operativa di Endoscopia dell’IRCCS CROB di Rionero in Vulture ci dirà come siamo fatti, visti da dentro, e quali sono le relazioni fra alimentazione e tumori al colon retto
Informazioni pratiche (in corso di definizione):
- Quando: il giorno 14/02/2018, presumibilmente si inizia verso le 19.30
- Dove: a Potenza, presso Beer Bros, Via Mantova, 175, tel. 329 349 0239
- Altro: come di consueto dovete provvedere personalmente alla prenotazione (preferibilmente per telefono) specificando che prenotate per partecipare alla “Lezione e tutta birra”
Literature cited, project 2017J2RMTN
- Berni Canani, , De Filippis, F., et al. 2017. Appl. Environ. Microbiol. 83: e01206-17. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.01206-17.
- Bokulich, N. A., Mills, D.A. 2013. Appl. Environmen. Microbiol. 79: 2519–226. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.03870-12.
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Holmes, S. P.. 2017. ISME J. 11: 2639–4263. https://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.119.
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A.J.A., Holmes, S. P. 2016. Nature Meth. 13: 581–583. https://dx.doi.org/10.1038/nmeth.3869.
- De Filippis, F., Parente, E., Ercolini, D. 2017a. Microbial Biotechnol. 10: 91–102. https://dx.doi.org/10.1111/1751-7915.12421.
- De Filippis, F., Laiola, M., Blaiotta, G., Ercolini, D.. 2017b. Appl. Environ. Microbiol., 83: e00905–17. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.00905-17.
- De Filippis, F., Parente, E., Danilo Ercolini. Ann. Rev. Food Sci. Technol. 9. https://dx.doi.org/10.1146/annurev-food-030117-012312.
- De Filippis, F., Parente, E., Zotta, T., Ercolini, D. 2018b. J. Food Microbiol. 265: 9–17. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2017.10.028.
- EFSA (2015). The food classification and description system FoodEx 2 (revision 2). Supporting publication 2015:EN-804. http://www.efsa.europa.eu/en/supporting/pub/215e.htm
- Emerson, J. B., Adams, R. I., Betancourt Román C. M., Brooks, B., Coil, D. A., Dahlhausen, Holly H. Ganz, K., et al. 2017. Microbiome 5: 86. https://dx.doi.org/10.1186/s40168-017-0285-3.
- Erkus, O., de Jager, V.C.L., Geene, R. T. C. M., van Alen-Boerrigter, I., Hazelwood, L., van Hijum, S. A .F. T., Kleerebezem, M., Smid, E. J. 2016. Int. J. Food Microbiol. 228: 1–9. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2016.03.027.
- Faust, K., Raes, J. 2016. F1000Research 5: 1519–14. https://dx.doi.org/10.12688/f1000research.9050.2.
- Fouhy, F., Clooney, A. G., Stanton, C., Claesson, M.J., Cotter, P. D. 2016. BMC Microbiol. 16: 123. https://dx.doi.org/10.1186/s12866-016-0738-z.
- Garofalo, C., Osimani, A., Milanovic, V., Aquilanti, L., De Filippis, F., Stellato, G., Di Mauro, S., Turchetti, B., Buzzini, P., Ercolini, D., Clementi, F., 2015. Food Microbiol. 49: 123-133. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2015.01.017
- Humblot, C., Guyot, J.-P. 2009. Appl. Environ. Microbiol. 75: 4354–4361. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.00451-09.
- Kuuliala, L., Al Hage, Y., Ioannidis, A.-G., Sader, M., Kerckhof, F.-M., Vanderroost, M., Boon, N. et al. 2018. Food Microbiol. 70: 232–44. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2017.10.011.
- Layeghifard, M., Hwang, D. M., Guttman, D. S. 2017. Trends Microbiol. 25: 217–28. https://dx.doi.org/10.1016/j.tim.2016.11.008.
- Levy, S.E., Myers, R.M. 2016. Annu. Rev. Genom. Hum. Genet. 17:95-115. https://dx.doi.org/10.1146/annurev-genom-083115-022413
- McDonald, D., Price, M.N., Goodrich, J., et al. 2012. ISME J. 6(3): 610-618. https://dx.doi.org/1038/ismej.2011.139.
- McMurdie, P. J., Susan Holmes. 2015. Bioinformatics 31: 282–283. https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu616.
- Mitchell, A. L., Scheremetjew, M., Denise, H., Potte, S., Tarkowska, A., Qureshi, M., Salazar, G. A., et al. 2018. Nucleic Acids Research 46: D726–35. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx967.
- Nature Editorial 2016. Nature Microbiology 1: 16112. https://dx.doi.org/10.1038/nmicrobiol.2016.112
- Parente, E., Cocolin, L., De Filippis, F., Zotta, T., Ferrocino, I., O’Sullivan, O., Neviani, E., De Angelis, M., Cotter, P. D., Ercolini, D. 2016. Int. J. Food Microbiol. 219 28–37. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.12.001.
- Parente, E., Zotta, T., Faust, K., De Filippis, F., Ercolini, D. 2018. Food Microbiol. 73: 49-60. https://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2017.12.010.
- Quast, C., Pruesse, E., Yilmaz, P., Gerken, J., Schweer, T., Yarza, P. et al. 2013. Nucl. Ac. Res. 41 (Database issue): D590–96. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gks1219.
- Qin J, et al. 2010. Nature. 464: 59-65. https://dx.doi.org/10.1038/nature08821.
- Quince, C., Walker, A.W., Simpson, J.T., Loman, N.J., Segata, N. 2017. Nat. Biotechnol. 35: 833-844. https://dx.doi.org/10.1038/nbt.3935.
- Sedlar, K., Kupkova, K., Provaznik, I. 2017. Comput. Struct. Biotecnol. J. 15: 48-55. https://dx.doi.org/1016/j.csbj.2016.11.005.
- Singer, Esther, Bill Andreopoulos, Robert M Bowers, Janey Lee, Shweta Deshpande, Jennifer Chiniquy, Doina Ciobanu, et al. 2016. Scientific Data 3: 160081. https://dx.doi.org/10.1038/sdata.2016.81.
- Stellato, G., De Filippis, F., La Storia, A., Ercolini, D. 2015. and Envirn. Microbiol. 81:7893-7904. https://dx.doi.org/10.1128/AEM.02294-15.
- Thompson, L. R, Sanders, J. G., McDonald, D., Amir, A., Ladau, J., Locey, K. J., Prill, R. J. et al. 2017. Nature 104: 457-465. https://dx.doi.org/10.1038/nature24621.
- Vandeputte, D., Tito, R.Y., Vanleeuwen, R., Falony, G., Raes, J. 2017. FEMS Microbiol. Rev. 41: S154–67. https://dx.doi.org/10.1093/femsre/fux027.
- Zhou, J., He, Z., Yang, Y., Deng, Y., Tringe, S. G., Alvarez-Cohen. L. 2015. mBio 6 (1). https://dx.doi.org/10.1128/mBio.02288-14.
Sicurezza e conservazione degli alimenti
Le lezioni del corso di Sicurezza e conservazione degli alimenti 9 CFU (LM Scienze e Tecnologie Alimentari) inizieranno il giorno 3/10/2017 alle ore 11.30 presso l’aula A9 e proseguiranno con il seguente orario:
Martedì 11:30-13:30 A9
Mercoledì 15:00-17:00 A9
Giovedì 09:30-11:30 A9
Le esercitazioni si svolgeranno nel laboratorio informatico della Scuola SAFE in orari da concordare.
Novità sulla didattica
A partire dall’AA 2016-2017 l’insegnamento di Microbiologia degli alimenti fermentati per il corso di Laurea Magistrale in Scienze e Tecnologie Alimentari è soppresso. Al suo posto insegnerò Sicurezza e conservazione degli alimenti (9 cfu, la pagina web è qui). Le ragioni di questa scelta sono in parte legate alla necessità di adeguare il percorso formativo del corso di studi. Per gli studenti delle coorti precedenti a quella 2016-2017 (in pratica per tutti quelli immatricolati l’anno scorso o negli anni precedenti) sarà comunque possibile sostenere l’esame (orale) nelle sessioni di esame ordinarie e straordinarie.
Inoltre, a partire da quest’anno non coprirò l’insegnamento di Gestione del rischio microbiologico 6 cfu. Presiederò comunque la commissione si esami fino ad aprile 2017.
MIND@FoodMicro2016
We will be in Dublin for FoodMicro 2016. Here you can download .pdf versions of our posters. You can find more in the FoodMicrobionet website.
- PO1-FB-075 DIVERSITY OF STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS POPULATIONS BY PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE (SER-B) POLYMORPHISMS Teresa Zotta*, Annamaria Ricciardi, Francesca De Filippis, Danilo Ercolini, Eugenio Parente
- PO1-FB-074 PURIFICATION AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF HEME-DEPENDENT CATALASE IN RESPIRATIVE STRAIN LACTOBACILLUS CASEI N87 Teresa Zotta, Antonio Varriale, Rocco G. Ianniello, Eugenio Parente, Maria C. Staiano, Annamaria Ricciardi
- PO1-FB-073 EFFECT OF RESPIRATIVE AND CATALASE-POSITIVE CULTURES OF LACTOBACILLUS CASEI ON THE PRODUCTION OF CHEDDAR CHEESE Annamaria Ricciardi, Anna Reale, Rocco G. Ianniello, Felicia Ciocia, Tiziana Di Renzo, Teresa Zotta, Floriana Boscaino, Raffaele Coppola, Eugenio Parente, Paul L. H. McSweeney
Master in Sicurezza degli alimenti, Universidad de Jaen
Vi segnalo questo master, e vi ricordo che abbiamo un accordo Erasmus con l’Universidad de Jaen. Per saperne di più cliccate qui.